189 件の論文
この論文は、PacBio および Oxford Nanopore のロングリードシーケンシングとハイブリッドキャプチャ法、ならびに専用解析ツール「HLA-Resolve」を組み合わせたワークフローを開発し、従来の短リード法や PCR 依存手法の限界を克服して、臨床応用可能な高解像度 HLA ハプロタイプ解析を低コストで実現したことを報告しています。
この研究は、大規模ゲノム解析を用いて、肥満や脂質異常などの従来のリスク因子とは独立して、分枝鎖アミノ酸代謝が遺伝的に2 型糖尿病および冠動脈疾患の発症に関与していることを初めて明らかにしました。
この研究は、日本人コホートにおいて、欧米由来ではなく日本人のゲノムデータに基づいて構築されたアルツハイマー病の多遺伝子リスクスコアが、MMSE による認知機能低下と最も強く関連しており、臨床現場での認知障害の層別化に有用であることを示しています。
本研究は、セロトニントランスポーター遺伝子（SLC6A4）の低活性型遺伝子多型とプロモーター領域の DNA メチル化が、高齢期における認知機能の低下と抑うつ傾向の併発リスクを増大させる一方、高活性型は海馬体積の維持を通じてこれらの加齢に伴う機能低下に対する抵抗性を示すことを、複数のコホート研究とメカニズム解析から明らかにしました。
FDA 有害事象報告システム（FAERS）の構造的課題を解決し、データ標準化、重複排除、シグナル検出を包括的に自動化する高精度な R パッケージ「faers」を開発し、その有効性とスケーラビリティを実証した。
本論文は、手 X 線画像と深層学習を用いて希少骨疾患の診断精度を向上させる次世代表現型解析ツール「Bone2Gene」の有効性を示す概念実証研究である。
このシステマティックレビューとメタアナリシスは、希少疾患の診断における大規模言語モデルの性能が評価ベンチマークの疾患構成や知識拡張の有無によって大きく変動し、すべての研究に高いバイアスリスクが存在するため、臨床導入には独立した前向き研究と標準化された評価基準が不可欠であると結論付けています。
臨床的異質性を考慮して遺伝的負荷の高い症例を重み付けする新しいフレームワーク「StratGWAS」を開発し、シミュレーションおよび UK バイオバンクのデータを用いた検証により、標準的な GWAS 手法と比較して統計的検出力を向上させつつ特異性を維持し、より多くの遺伝子座を同定できることを示しました。
この論文は、500 以上の遺伝子における「優性かつ非必須」な疾患アレルを標的とし、共通するヘテロ接合性遺伝的変異を利用したアレル特異的ターゲティングによって、特定の突然変異に依存しない治療アプローチを可能にし、治療対象患者数を劇的に拡大できることを示しています。
本論文は、COVID-19 と他の呼吸器疾患の間に存在する共有および特異的な遺伝的構造を多オミクス解析により解明し、インターフェロン経路や表面活性物質代謝の異常など、COVID-19 の病態を特徴づける分子メカニズムを特定することで、新たな治療標的の発見と精密医療への貢献を示しました。
英国のUPNATが提案したこのフレームワークは、希少疾患に対するアンチセンス治療薬の開発と患者選定を、疾患に依存せず体系的かつ公平に優先順位付けし、透明性と再現性を高めることを目的としています。
この研究は、肺腺がんの WHO 組織学的サブタイプが独自の免疫細胞プロファイルや生存率に関連する遺伝子発現パターンを有しており、これらが免疫療法の反応性予測や臨床試験の設計に有用であることを示しています。
この論文は、49 万人以上の英国バイオバンクの全ゲノム配列データを解析し、STAARpipelinePheWAS という拡張可能なフレームワークを用いて、1,342 の表現型に対して 49,121 のゲノムワイド有意な遺伝子 - 形質ペアを同定し、特に従来見逃されていた非コード領域の希少変異が疾患やバイオマーカーに及ぼす影響を包括的にマッピングしたことを報告しています。
WFS1 遺伝子変異の種類と位置に基づいた重症度スコアリングシステムが、ウォルフラム症候群の糖尿病や視神経萎縮の発症時期を予測する上で有用であることが示されました。
英国バイオバンクのデータを用いた本研究は、コピー数変異（CNV）の表現型への影響がポリジニックスコア（PGS）と相加的に作用し、その正の相関は選択的交配（アソルティブ・メイトイング）によって説明されることを示し、これにより CNV や稀な変異の可変的な発現と臨床的リスクの特定が向上することを明らかにした。
本研究は、卵巣がんの転移や治療反応性を解明するため、125 人の患者から得られた 404 検体の大規模な全ゲノムメチル化データを提供し、治療抵抗性のメカニズムや液体生検によるモニタリングの可能性を明らかにしたものです。
アルジェリアにおいて、国内の遺伝子データベースの不足や血縁婚の多さといった構造的課題にもかかわらず、自律的な全エクソームシーケンシングワークフローを確立することで神経発達障害の診断に成功し、地域固有の参照データや倫理枠組みの整備が遺伝子医療の持続的導入に不可欠であることを示した。
この研究は、統合的なクロスオミクス解析を用いてアルツハイマー病と 2 型糖尿病の遺伝的関連を解明し、両者の関係が単純な共通リスクモデルではなく、アポE や HLA などの特定の遺伝子座における局所的な異質性や、多くの遺伝子で発現・メチル化レベルにおいて逆方向の影響を示す拮抗的遺伝多様性によって特徴づけられることを明らかにしました。
本論文は、がん感受性遺伝子における生殖系列バリアントの解釈を支援し、臨床データや機能研究結果、診断センター間の協力を可能にする無料のオンラインプラットフォーム「CanVar-UK」の機能と利用実績について述べています。
この研究は、ベルリン・エイジング・スタディ II のデータを用いた大規模解析により、14 種類のエピジェネティック・クロックの中で DunedinPACE が高齢者の認知機能低下と最も一貫して強く関連するバイオマーカーであることを明らかにしました。